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生产及流通过程细菌污染溯源:利用基因组测序的高分辨率,从不同环节或者关键位点取样检测,与污染菌进行一致性比对分析,分析得到污染菌的来源,准确找到污染源头,从而找到解决方法,保证产品质量。

“伪”沙门氏菌准确鉴定,避免产品召回

产品召回需要获得最准确的微生物信息,如果发生沙门氏菌污染,没有哪一种生化实验能像遗传信息那样能准确的鉴定。高价值冷藏和即食食品的生产商在某一天了解到他们可能发生一项严重的问题,以至于必须从四个欧洲国家召回他们的其中一种产品。

公司的检验室确定公司向成百上千出售供货商供应的肉和蔬菜沙拉可能受到沙门氏菌的污染,在3天内,样本已经使用酶联免疫吸附、胶乳凝集、生化筛查(97%的确定性)和血清学检验进行测序,所有这些结果均表明它们受到沙门氏菌污染,主管人员认为不得不产品召回。

但召回产品对于公司形象和损失巨大,于是召回之前,公司选择了一家第三方检验机构确认是否有污染。蔬菜沙拉

样本被送到一家第三方检验公司,使用全基因组测序进行快速鉴定,鉴定结果发现,该菌并非沙门氏菌,而是柠檬酸杆菌的一种,与沙门氏菌的近亲,曾使用生化试验分析模仿其亲戚的历史。色拉公司的加工实验室以前碰到过弄错结果的问题,但是从未深入到这一步。

几乎要产品召回的灾难得以避免,如果产品召回,公司将直接损失几十万美元,间接损失不可估量。

相比基因组测序检验鉴定,常规试验检测、生化检测、血清检测、甚至一些知名快速检测系统的准确度与之差距很远。在解决各种微生物引起的问题中,基因组测序的检验鉴定结果更能说明问题所在,藉此避免污染的产生或者尽最大程度降低可能的损失。

 

9204微生物鉴定指导原则:“为了确证微生物为同种中的两个相同株,需比对更多的基因序列和特征基因片段,甚至是全基因的比对,实现既鉴定又溯源的目的,同时保证结果的准确性。”