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生产及流通过程细菌污染溯源

利用基因组测序的高分辨率,从不同环节或者关键位点取样检测,与污染菌进行一致性比对分析,分析得到污染菌的来源,准确找到污染源头,从而找到解决方法,保证产品质量。 

供应商产品质量检测

当工业产品原料突然出现问题是,首先要知道的是罪魁祸首是什么以及来源是哪里。当问题指向为微生物时,基于全基因组测序的物种鉴定分型可追踪污染溯源,找到解决问题的方法。

干粉某工厂生产一种干粉,但由于一种未知污染物而面临严重的质量控制问题。我们知道,干粉颗粒大小对产品质量评价非常关键,必须要保证粉末加工成大小合适并且保持一致的颗粒,而未知污染物导致公司一度面临长期的严重损失。

基于常规生化实验确定成品中存在一种杆菌,腐烂的原材料是主要的怀疑对象,但是进一步生化实验发现,在有问题的产品批次中和没有问题的产品批次中都有这种杆菌的存在。质控管理人员就感觉很奇怪,这是为什么呢,同样含有杆菌,有些合格,有些不合格呢?

管理人员一度还怀疑工厂设计问题或者散装材料的来源多是污染源,但他们无法取证,也无法跟踪。还有一点是,那种杆菌能够在整个生产工艺加工方法中存活,同时如果形成孢子后能在消毒清洁过程中存活下来。

公司每天取样记录,一年中累计了大量的生化评测信息,但并未能找到原因,穷尽了各种常规检测,该公司决定看看从不同物品中得到的杆菌是否有不同之处,从基因组上能得到最直观的信息。

通过分别检测正常批次和变质批次中的样本,在全基因组水平上进行鉴定比对,这种精细的检测方法发现产品中有多种杆菌,但马上分辨出其中有一种杆菌只在变质的批次中出现并紧密相关。这里先要说明的是,这是一种基于DNA的检测方法,在环境或者或者活性变化的情况下,细菌的核心基因DNA不会随之改变。

基于此最终确定了污染菌,但需要继续追溯来源。接下来工作人员从工厂环境及原料样品中分别检测,在全基因组水平上鉴定分型,很快目标锁定到一种原材料,从该材料中检测到的杆菌与污染菌具有高度的一致性。

该材料的供应商是来自一个世界知名的经纪商,于是工作人员前往该经纪商的供货码头,在货船抵达码头时进一步取样,分析发现只有来自于欧洲某个国家的供应材料中发现了污染菌。

解决方案:

1.工厂与经纪商沟通更换供货源头,从根本上解决污染问题。

2.对检测过程中发现的工厂中一些受到污染的区域进行清洁与消毒。

3.定期对原材料及工厂环境和生产线进行采样监督检测,避免出现问题后的重大损失,包括产品损失和昂贵复杂的清洁过程等。

9204微生物鉴定指导原则:“为了确证微生物为同种中的两个相同株,需比对更多的基因序列和特征基因片段,甚至是全基因的比对,实现既鉴定又溯源的目的,同时保证结果的准确性。”