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全基因组测序在耐药结核病监测中的应用

Mcnerney R , Zignol M , Clark T G . Use of whole genome sequencing in surveillance of drug resistant tuberculosis[J]. Expert Review of Anti-infective Therapy, 2018, 16(5). 耐药结核病是对全球公共卫生的威胁。 目前用于监测表型药物敏感性测试(DST)的方法周期长、成本高、技术上具有挑战性,并且需要具有高水平微生物安全性的专门实验室,同时测试的药物数量有限。...

WGS用于结核病耐药检测——坦桑尼亚西北部

Genotypic Drug Resistance using Whole-genome Sequencing of Mycobacterium tuberculosis Clinical Isolates from North-western Tanzania 来自坦桑尼亚西北部的结核分枝杆菌分离株的遗传耐药性特征包括常见突变。 一线和二线耐药结核病以及耐多药结核病的患病率很低。 耐药菌株属于不同的进化枝,表明该区域的耐药性TB的传播是有限的。 使用WGS的进一步研究将监测现有耐药菌株的扩散和新菌株的出现。 背景...

NGS用于结核病耐药监测——乌克兰

Next-Generation Sequencing for Characterizing Drug Resistance-Conferring Mycobacterium tuberculosis Genes from Clinical Isolates in the Ukraine 摘要 乌克兰是世界上耐多药耐药(MDR)和广泛耐药(XDR)结核病例最多的前20个国家之一。然而,该区域临床分离株的遗传多样性(即抗性特征)知之甚少。...

基因测序用于监测高流行国家结核病的耐药性——多国人群监测研究

    Genetic sequencing for surveillance of drug resistance in tuberculosis in highly endemic countries: a multi-country population-based surveillance study 背景: 对抗结核药物的耐药性进行有效监测,可以估计疾病负担、规划诊断和治疗服务、监测结核病控制干预措施的有效性以及设计有效的标准治疗方案,并最终可提供最合适的、个性化的患者护理方案。...

结核病全基因组测序实例

一个案例说明了WGS对结核病检测的巨大影响,以及它在快速检测和预防耐药性结核菌株在普通人群中的传播中的核心作用。 诊断时间线: 2月: 患者男,38岁,意思结核病住院,采集了几个谈样本并进行培养检测 3月: 经过一个月的培养,其中一个样本结核病培养阳性 3月23日: 培养阳性样本送至参比实验室进行药物敏感性检测 4月14日: 样本在参比实验室进行全基因组测序,用于检测耐药突变判断耐药型 4月20日:...